主办单位: | 浙江清华长三角研究院 | 师资信息 | 徐广锐 |
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联系人: | 庞锐 | 联系电话: | 82586670 |
开班时间: | 2018-07-07 | 开班地点: | 浙江清华长三角研究院 |
培训科目: | 生物-生物信息学基础及常用工具 | 培训人数: | 17 |
在生物信息学基本知识的基础之上,介绍目前在生物信息学研究中目前常用的数据库、研究工具以及一些研究实例。使学员通过本课程的学习,对生物信息学的发展历史、研究内容以及主要研究手段有一个基本的了解,能够利用一些常用工具进行简单的生物信息学分析。
第一章 生物信息学的概念及其发展历史(3学时)
1. 生物信息学的发展历史
2. 生物信息学的研究领域
3. 生物信息学的主要应用
4. 生物信息学面临的挑战
第二章 生物学数据库及其检索(3学时)
1. 生物学数据库简介
2. 生物学数据库的内容与结构
3. 生物学数据库的检索
第三章 序列比对原理(3学时)
1. 序列比对相关概念
2. 序列比对打分方法
3. 序列比对算法
4. 序列比对工具
5. 多序列比对
第四章 真核生物基因组的注释(3学时)
1. 蛋白质编码基因的注释
2. RNA基因的注释
3. 重复序列的注释
4. 假基因的注释
第五章 转录组学(3学时)
1. 转录组学概述
2. 试验设计和测序流程
3. 转录组数据核心分析
4. 功能分析
5. RNA-seq数据分析案例
考试(3学时)